Как же не единственное?  А права членов семьи, равноправных владельцев?

Попробую примером с точностью наоборот. В квартире проживает должник, у которого это не единственное жилье, но он предоставил его в пользование членам семьи, у которых оно единственное. Что в этом случае?

Предполагаю, что чиновники из вашего муниципалитета не знали о введении в действие Закона о государственной регистрации в 1998 году. И ждали изменений в ст. 7 Закона о приватизации. Но и они (изменения) произошли до того, как вам записали этот текст в договоре… ...

О каком Законе идет речь понять трудно.

Федеральный закон «О государственной регистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним». Статья 6. Признание ранее возникших прав 1. Права на недвижимое имущество, возникшие до момента вступления в силу настоящего Федерального закона , признаются юридически ...

Причем тут Администрация района? Есть Федеральный закон.

Начиная с 1998 года право собственности подлежит обязательной государственной регистрации. У Вас оно не зарегистрировано. Соответственно не возникло, пока.

При спорах о праве пользования квартирой ЖСК применяют нормы ст. 19 Вводного закона и признают за жильцами пожизненное право пользования квартирой собственника.

В Санкт-Петербурге вовсю применяют аналогию закона по договорам соцнайма к квартирам ЖСК.

Для ответа на Ваш вопрос нужно понять, что такое «жилищное агентство» (?) в котором Вы регистрировали право собственности. Сам договор регистрации не подлежит и считается заключенным с момента его подписания.